Este espaço expositivo está instalado na Igreja do Carmo e dedica-se a exibir peças de arte relacionadas com o património religioso da ilha do Faial, através de exposições de carácter permanente e temporário. A exposição permanente do Museu é composta por peças de diversas proveniências, nomeadamente da Diocese de Angra, da Ordem Terceira do Carmo, da Ordem Terceira de São Francisco e da Matriz do Santíssimo Salvador. Neste museu, é possível ver peças de estatuária, de ourivesaria e de paramentaria. Especial destaque para uma compilação de esculturas flamengas do século XVI e outras imagens religiosas dos séculos XVII e XVIII, talha dourada, azulejaria e pintura.